Qarabağ Regional Təhsil İdarəsi Azərbaycan Respublikası Prezidentinin “Azərbaycan Respublikası Təhsil Nazirliyinin strukturunun təsdiq edilməsi haqqında” 2010-cu il 27 dekabr tarixli 1251 nömrəli və “Azərbaycan Respublikası Təhsil Nazirliyinin strukturunun təkmilləşdirilməsi haqqında” 2014-cü il 24 iyul tarixli 664 nömrəli sərəncamlarında dəyişiklik edilməsi barədə Azərbaycan Respublikası Prezidentinin 20 dekabr 2021-ci il tarixli Sərəncamına əsasən Ağcabədi, Ağdam, Bərdə, Füzuli, Xocalı, Xocavənd, Şuşa və Tərtər rayon təhsil şöbələrinin əsasında yaradılıb.
Azərbaycan Respublikası Təhsil nazirinin 11.04.2022-ci il tarixli F-184 nömrəli əmri ilə “Regional Təhsil İdarəsinin Nümunəvi əsasnaməsi” təsdiq edilib.
Təhsil naziri Emin Əmrullayevin 29.04.2022-ci il tarixli K-386 nömrəli əmri ilə Gündüz Əbdülov Qarabağ Regional Təhsil İdarəsinin müdiri təyin olunub.
Qarabağ Regional Təhsil İdarəsinin tabeliyində 447 ümumtəhsil müəssisəsi, 178 məktəbəqədər təhsil müəssisəsi, 14 məktəbdənkənar təhsil müəssisəsi fəaliyyət göstərir